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Infiltración

En este paso la muestra se coloca en parafina líquida, cabe mencionar que se debe usar parafina histológica. Como se ha dicho en el paso anterior el tejido está completamente lleno de xilol, ahora debido a  ósmosis  sale el xilol y entra la parafina. La deshidratación, aclaramiento e infiltración pueden ser realizadas manualmente pero hoy en día se realizan de modo automático en máquinas específicas.

Inclusión

Tiene como finalidad proporcionarle al tejido un soporte sólido que posibilite realizar un corte muy fino, por lo que es de suma importancia que el medio utilizado para la inclusión penetre al interior del tejido. Aquí se forman bloques de parafina dentro de los cuales están las muestras a estudiar. También hay máquinas especializadas para la inclusión en parafina de tejidos. Después de su inclusión y posterior secado, estos se deben poner a enfriar en un congelador para su posterior corte. Puede llevarse a cabo en Parafina

Microtomía

Se realizan  cortes histológicos  muy delgados según lo requerido o la costumbre del laboratorio donde se realice la técnica. Los cortes van desde 0,5 micras hasta 8 u 10 micras. Los cortes se echan al baño de flotación y se ´pescan´ con un portaobjetos, se marcan con la fecha, el tipo de tejido y la tinción con que se van a procesar. El ángulo de corte entre el cuchillo del microtomo y el bloque ha de estar entre 10º y 15º. Una vez realizado el corte se da un baño de agua destilada, para que la parafina se estire. Un buen corte histológico debe tener un grosor aproximado de 3-5 micras para que sea fácilmente atravesado por la luz del sol y atraviese los poros celulares.

Tinción

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Las células, por sí mismas, no poseen coloración. Por tanto, para poder observar la morfología tisular deben "teñirse". Existen muchos tipos de tinciones para diferenciar las distintas estructuras o sustancias en los tejidos. La tinción más usada o también llamada "de rutina" es la de  hematoxilina  y  eosina  (H&E). Se usa un colorante llamado hematoxilina que tiñe las sustancias ácidas o que las contengan, como el núcleo que contiene ácido desoxirribonucleico ( ADN ) La eosina amarillenta tiñe las estructuras básicas como el  citoplasma  y demás orgánulos  eosinofílicos  de la  célula . Como se mencionó anteriormente hay muchas tinciones . Otros ejemplos son: Masson PAS Perls Plata metenamina Warthin-Starry Ziehl-Neelsen Van Gieson Azul alcian Sudán III Rojo Congo

Observación

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Como se mencionó al principio algunos autores no consideran la observación como un paso de la técnica histológica sino el objetivo final de la misma. Como se puede deducir, se observa la laminilla al microscopio y se busca lo que se necesite ver para llegar a un diagnóstico. La técnica histológica es muy empleada en laboratorios y hospitales. Permite hacer diagnósticos de distintas enfermedades, como para saber si un tumor es maligno o benigno, etc.